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Biotecnolog铆a

29/10/2019

Secuencian el genoma de un hongo que afecta a la soja

Se logr贸 describir, por primera vez, el genoma completo de Cercospora kikuchii: un pat贸geno que causa el tiz贸n morado de la hoja y la mancha p煤rpura de la semilla.
En la semilla se ve un manchado morado que va desde peque帽as manchas hasta cubrirla completamente.

Un equipo de investigadores del INTA, la FAUBA y otras instituciones logr贸 describir, por primera vez, el genoma completo de Cercospora kikuchii. Se trata de un pat贸geno que causa el tiz贸n morado de la hoja y la mancha p煤rpura de la semilla.聽

El conocimiento del genoma del hongo que genera la enfermedad foliar de mayor crecimiento en los 煤ltimos a帽os en el pa铆s, permite imaginar 鈥揺n un futuro cercano鈥 el descubrimiento de mol茅culas fungicidas novedosas y de alto impacto para el control de estas enfermedades. El hallazgo fue publicado recientemente en la revista聽Science聽y se帽ala que, por primera vez, se logr贸 describir el genoma completo de聽Cercospora kikuchii.

Con 31.1 millones de pares de bases, el genoma completo contiene 14.721 genes. El acceso a esta informaci贸n aporta conocimiento para el control de las principales enfermedades que afectan a la soja. 鈥淓s la primera vez que se describe el genoma de聽Cercospora kikuchii, lo que nos permite conocer el genoma del pat贸geno que causa la enfermedad de la mancha p煤rpura de la hoja鈥, destac贸 Paula Fern谩ndez, investigadora del Instituto de Biotecnolog铆a del INTA y CONICET.

Al describir el genoma 鈥減odemos revelar mecanismos esenciales de la vida del hongo, con lo cual estamos en condiciones de redescubrir productos, mol茅culas o agentes de control que puedan llegar a bloquear estos mecanismos que hasta hoy no eran muy conocidos, lo que nos abre una multiplicidad de opciones de estudio鈥, reconoci贸 Marcelo Carmona, profesor de la Facultad de Agronom铆a, Universidad de Buenos Aires (UBA).

Este pat贸geno presenta s铆ntomas en semillas, tallos, hojas y vainas y afecta el n煤mero y peso de los granos en el cultivo de soja. El s铆ntoma foliar t铆pico incluye coloraci贸n morada, bronceado a p煤rpura, con aspecto rugoso. Mientras que en la semilla se manifiesta un manchado morado que va desde peque帽as manchas hasta cubrirla completamente.

Su manejo consiste en la utilizaci贸n de semillas sanas o tratadas eficientemente, rotaci贸n de cultivos, uso de cultivares de mejor comportamiento y control qu铆mico con fungicidas. En la actualidad, la eficiencia de los fungicidas para combatirlo se vio reducida como consecuencia del surgimiento de diversas mutaciones que confieren resistencia en varias cepas de聽Cercospora聽spp.

A partir de ahora, se tratar谩 de conocer 鈥los genes candidatos que afecten la infecci贸n de este pat贸geno en la soja, los mecanismos de posible tolerancia o resistencia a nuevos fungicidas, as铆 como tambi茅n los procesos que genera la planta para poder resistir a la infecci贸n del pat贸geno鈥, explic贸 Fern谩ndez.

Sumar el genoma de este hongo a la secuencia completa del genoma de la soja 鈥揹escifrado hace casi 10 a帽os鈥, 鈥減osibilitar谩 identificar desde marcadores moleculares hasta genes candidatos de la infecci贸n鈥, reconoci贸 la investigadora. De acuerdo con lo publicado, las futuras investigaciones estar谩n dirigidas a interpretar todos los atributos con los que cuenta la planta para defenderse, as铆 como los mecanismos del pat贸geno para infectar y colonizar.

Para lograr el objetivo, los investigadores de la FAUBA tuvieron la tarea de aislar el pat贸geno para extraerle el ADN y poder secuenciarlo, mientras que en el Instituto de Biotecnolog铆a del INTA se realiz贸 el ensamblado mediante herramientas de bioinform谩tica, tarea comandada por Sergio Gonzalez. La investigaci贸n cont贸 con aportes del INTA, UBACyT y BASF.

Fuente: INTA / CONICET

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